بالاکوٹ کے بعد تحریک کے مرکز سِتھانہ کے مجاہدین کے خلاف برطانوی مہم کو یوسف زئی قبائل کی سخت مزاحمت کا سامنا کرنا پڑا؛ انگریز کو بھاری نقصان کے بعد امن لینا پڑا۔
بالاکوٹ کے بعد سید احمد شہیدؒ کی تحریک کے ساتھیوں نے شمال مغربی سرحد میں سِتھانہ کے مقام کو اپنا مرکز بنایا، جہاں مولانا ولایت علیؒ، مولانا عنایت علیؒ اور مولانا احمد اللہ جیسے صادق پور (پٹنہ) کے علما ہندوستان سے رجال اور رقم کی فراہمی جاری رکھتے تھے۔ ان مجاہدین کو انگریز 'ہندوستانی متعصب' کہتے تھے۔
1863ء میں برطانوی حکومت نے سِتھانہ کے مجاہدین کو ختم کرنے کے لیے ایک بڑی فوج کے ساتھ عنبیلہ (آمبیلہ) کے درے میں مہم بھیجی، جس میں یوسف زئی قبائل نے بھی مجاہدین کا ساتھ دیا۔ کئی ہفتوں کی سخت لڑائی میں انگریزی فوج کو بھاری جانی نقصان ہوا۔
آخر انگریزوں نے قبائلی سرداروں سے مذاکرات کیے اور فوج واپس بلا لی۔ اس مہم نے دکھایا کہ سرحدی قبائل انگریزوں کے لیے مسلسل مسئلہ رہیں گے، جس کے بعد ہندوستان کے اندر مجاہدین کے حمایتیوں کے خلاف مقدمات کی کارروائیاں تیز کی گئیں۔